Le 25 octobre 2021, le chef militaire soudanais, le général Abdel Fattah al-Burhan, a pris le contrôle du gouvernement lors d'un coup d'État et a initialement arrêté plusieurs responsables civils du gouvernement, dont le Premier ministre civil Abdalla Hamdok. Les manifestants soudanais ont été confrontés à la violence des forces de sécurité gouvernementales, notamment des meurtres, des disparitions forcées, des tortures, des violences sexuelles contre les femmes, des passages à tabac, des arrestations et des détentions. Hamdok, qui a été réintégré en novembre 2021, a démissionné en janvier 2022, citant le glissement du Soudan vers un « tournant dangereux qui menace sa survie », laissant l'armée aux commandes. L'instabilité politique a paralysé les efforts visant à améliorer les droits de l'homme et à réformer le secteur de la sécurité.

Suite à la décision du Conseil de sécurité de l'ONU de mettre fin au mandat de la mission hybride Union africaine-Nations unies au Darfour (MINUAD), la violence s'est poursuivie au Darfour, avec une recrudescence notable dans la région occidentale.

Le 15 avril 2022, le procès d'Ali Kosheib devant la Cour pénale internationale a commencé. Kosheib est accusé de 31 chefs de crimes de guerre et de crimes contre l'humanité commis en 2003 et 2004. Les mandats d'arrêt contre l'ex-président el-Béchir et deux de ses associés sont toujours en suspens.

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