洪马内（Hun Manet）于2023年担任柬埔寨总理后，柬埔寨的人权境况愈发恶化。政府展开有计划的行动，全面压制一切异见。执政的柬埔寨人民党掌控包括司法部门在内的所有政府机构。柬埔寨政府任意拘留异议人士以示惩戒 ，常常加以逼供或要求公开道歉，对逃至海外的批评人士则进行行广泛监视和跨国镇压。
政治压迫与跨国镇压
烛光党、高棉意志党和民族力量党等在野政党持续受压迫：政党领袖与支持者屡遭骚扰、任意拘捕及政治动机起诉。 5月，国家力量党资深顾问因煽动罪被判处4年徒刑。
9月，柬埔寨当局以叛国和煽动的罪名为由，大举逮捕反对派政治人物与社会运动人士，将他们关押在拥挤不堪的监狱中。截至11月，计有88名政治犯囚禁于牢。政治反对派领袖根索卡（Kem Sokha）于2023年因基于政治动机的叛国指控遭判27年的刑期，至今仍软禁在家。
柬埔寨政府同时经常施展跨国镇压的手段，压制恫吓流亡泰国、马来西亚和日本等国的批评人士与异议者。 1月，具法柬双国籍的前反对派国会议员林金亚（Lim Kimya）在曼谷被枪杀身亡，外界普遍认为是政治暗杀。泰国当局已将嫌犯逮捕起诉，但幕后主使仍待追查。
对公民社会及媒体的限制
包括公正柬埔寨（Equitable Cambodia）、劳权和人权联盟中心（CENTRAL）在内的公民社会组织成员因其倡议与诉求，遭受行政和法律骚扰以及刑事起诉威胁。柬埔寨当局一再援引定义宽泛的密谋、煽动、国家安全条款打压不同意见，公民社会如今基本上无法运作，实质的公民参与也几乎不可能。
媒体自由面临严峻威胁。柬埔寨当局对独立新闻机构与网站施以法律恐吓、审查及强制关闭，从事调查报导已成高度危险的工作。
2024年12月4日，环保记者乔恩琴（Chhoeung Chheng）在本佩野生动物保护区（Boeung Per Wildlife Sanctuary）附近调查非法伐木时被枪击，3天后离世。嫌犯于2025年5月定罪，但此例在袭击记者事件普遍不受惩罚的常态下实属罕见。
柬埔寨当局指控英国记者杰拉尔德・弗林（Gerald Flynn）使用“伪造”签证，将他列入禁止入境黑名单。此前不久，弗林在法国24新闻台播出的一部批评柬埔寨碳抵换计画的纪录片中接受访问。
7月31日，柬埔寨当局逮捕两名报导泰柬边境冲突后续的记者，随后依据刑法第445条以叛国罪将两人起诉，他们最高可被判处7至15年监禁。当局指控他们拍摄禁区照片，提供外国危害国防的资料。
联合国柬埔寨人权状况特别报告员于提交人权理事会的年度报告中强调，人权捍卫者和其他“被视为持不同政见者”因行使言论自由与和平集会权利遭当局以煽动罪和相关罪名起诉。
国籍法
2025年年中，柬埔寨政府通过宪法修正案与落实该案的法条，取消了柬埔寨法律禁止剥夺公民国籍的规定。前首相、现任参议院议长洪森在6月27号宣布，他已指示司法部部长研议可将“勾结外国势力损害国家利益”的柬埔寨人民撤销国籍的方案。
柬埔寨当局现今有权褫夺触犯叛国罪或被认定行为有损国家利益之个人的国籍。柬埔寨的公民社会团体谴责此法定义模糊、易遭任意援引，恐被当局用来压迫反对派人物、境外批评人和人权捍卫者。
环境捍卫者
柬埔寨政府持续打压环境运动。 2024年，数名柬埔寨自然之母（Mother Nature Cambodia）运动人士遭判6至8年徒刑。 5月，揭露非法伐木情况的环境记者吴茂（Ouk Mao）于上丁省（Stung Treng）遭到逮捕。其他调查记录森林砍伐与环境破坏的捍卫者正陆续遭当局指控散播虚假讯息或煽动制造 “社会动乱”。
环境运动人士乌伦（Ouch Leng）于2024年11月在上丁省调查保护林区非法伐木时被柬埔寨军方逮捕，此后持续受到骚扰。获释后，警方包围乌伦的住所，迫使他逃往国外。
原住民权利
柬埔寨现行法律繁琐复杂，原住民社群取得身份认证已是不易，还须面对障碍重重的产权申请程序，以致许多社群无法成功登记集体土地产权。土地权属缺乏保障，使得社群在面临农业企业、碳抵换计划及观光基础建设的威胁时，更易遭到强制迁离。
原住民社群深受掠夺式微型金融放贷之苦。微型金融机构接受由地方政府签发、但与社群集体土地产权重叠的“简易产权证书”作为担保，这种做法削弱了原住民土地的法律保护。过度负债导致强迫出售土地、粮食取得受限以及丧失传统生计和工作机会。人权观察和其他组织均曾报导与负债相关的原住民借款人自杀事件。
因应柬埔寨公民社会组织提出的投诉，国际金融公司的内部监督机制已完成相关调查，但截至发稿时，结果尚未公布。 2023年的初步审查发现借债人“蒙受损害的迹象”，以及国际金融公司绩效标准（包括原住民社区条款）遭到违反的情形，因此启动全面调查。
边境冲突与返国移驻劳工
泰国和柬埔寨的边境冲突于7月爆发，造成包括儿童在内的平民伤亡，约30万人流离失所，多处宗教和文化遗址毁坏。人权观察指出，争战时两国均在人口密集地区使用爆炸性武器。
冲突爆发前，争议边界上埋设的地雷将泰国兵士严重炸伤。泰国与柬埔寨皆批准1997年禁止地雷条约，该约全面禁止生产、转让、储存和使用杀伤人员地雷。柬埔寨指控泰国使用国际公约禁用的集束弹药。 10月25日，居住于柏威夏省靠近泰国边境地区的10岁男童森索万（Sern Sovann），据报从住家附近农地带回一件不明物品后不久即因爆炸身亡。柬埔寨指控该物是集束弹药的未爆残余，但泰国否认此说法。
两国停火协议于7月28日生效，但局势依然紧张。截至11月，仍有18名柬埔寨士兵被泰国羁押。
冲突爆发后，逾90万名柬埔寨移驻劳工因担忧受到骚扰自泰国返乡。柬埔寨政府也呼吁移工回国，并承诺提供就业机会，然而返国工人的基本生活条件急需援助且缺乏稳定生计。微型金融贷款的信贷人员上门催收欠款，让债务沉重的家庭压力倍增。
网络诈骗中心
网络诈骗园区将受害者贩运至柬埔寨并强迫他们从事犯罪活动，关于此类运作手法的报导不断增加。尽管当局偶有突击行动，但各方通报显示，网络诈骗园区的人权侵害一直存在结构性因素：遭囚禁者得不到保护，也难以获得支援与协助。
1月21日，柬埔寨当局拘留了两名记者，原因是他们分属的两家媒体发布了一段据称拍摄到金边网络诈骗园区使用酷刑的影片。警方将两人以煽动罪起诉，指控他们散播危及国家安全、有损国家领导人尊严的虚假信息。