洪馬內（Hun Manet）於2023年擔任柬埔寨總理後，柬埔寨的人權境況愈發惡化。政府展開有計劃的行動，全面壓制一切異見。執政的柬埔寨人民黨掌控包括司法部門在內的所有政府機構。柬埔寨政府任意拘留異議人士以示懲戒 ，常常加以逼供或要求公開道歉，對逃至海外的批評人士則進行行廣泛監視和跨國鎮壓。
政治壓迫與跨國鎮壓
燭光黨、高棉意志黨和民族力量黨等在野政黨持續受壓迫：政黨領袖與支持者屢遭騷擾、任意拘捕及政治動機起訴。5月，國家力量黨資深顧問因煽動罪被判處4年徒刑。
9月，柬埔寨當局以叛國和煽動的罪名為由，大舉逮捕反對派政治人物與社會運動人士，將他們關押在擁擠不堪的監獄中。截至11月，計有88名政治犯囚禁於牢。政治反對派領袖根索卡（Kem Sokha）於2023年因基於政治動機的叛國指控遭判27年的刑期，至今仍軟禁在家。
柬埔寨政府同時經常施展跨國鎮壓的手段，壓制恫嚇流亡泰國、馬來西亞和日本等國的批評人士與異議者。1月，具法柬雙國籍的前反對派國會議員林金亞（Lim Kimya）在曼谷被槍殺身亡，外界普遍認為是政治暗殺。泰國當局已將嫌犯逮捕起訴，但幕後主使仍待追查。
對公民社會及媒體的限制
包括公正柬埔寨（Equitable Cambodia）、勞權和人權聯盟中心（CENTRAL）在內的公民社會組織成員因其倡議與訴求，遭受行政和法律騷擾以及刑事起訴威脅。柬埔寨當局一再援引定義寬泛的密謀、煽動、國家安全條款打壓不同意見，公民社會如今基本上無法運作，實質的公民參與也幾乎不可能。
媒體自由面臨嚴峻威脅。柬埔寨當局對獨立新聞機構與網站施以法律恐嚇、審查及強制關閉，從事調查報導已成高度危險的工作。
2024年12月4日，環保記者喬恩琴（Chhoeung Chheng）在本佩野生動物保護區（Boeung Per Wildlife Sanctuary）附近調查非法伐木時被槍擊，3天後離世。嫌犯於2025年5月定罪，但此例在襲擊記者事件普遍不受懲罰的常態下實屬罕見。
柬埔寨當局指控英國記者傑拉爾德・弗林（Gerald Flynn）使用「偽造」簽證，將他列入禁止入境黑名單。此前不久，弗林在法國24新聞台播出的一部批評柬埔寨碳抵換計畫的紀錄片中接受訪問。
7月31日，柬埔寨當局逮捕兩名報導泰柬邊境衝突後續的記者，隨後依據刑法第445條以叛國罪將兩人起訴，他們最高可被判處7至15年監禁。當局指控他們拍攝禁區照片，提供外國危害國防的資料。
聯合國柬埔寨人權狀況特別報告員於提交人權理事會的年度報告中強調，人權捍衛者和其他「被視為持不同政見者」因行使言論自由與和平集會權利遭當局以煽動罪和相關罪名起訴。
國籍法
2025年年中，柬埔寨政府通過憲法修正案與落實該案的法條，取消了柬埔寨法律禁止剝奪公民國籍的規定。前首相、現任參議院議長洪森在6月27號宣佈，他已指示司法部部長研議可將「勾結外國勢力損害國家利益」的柬埔寨人民撤銷國籍的方案。
柬埔寨當局現今有權褫奪觸犯叛國罪或被認定行為有損國家利益之個人的國籍。柬埔寨的公民社會團體譴責此法定義模糊、易遭任意援引，恐被當局用來壓迫反對派人物、境外批評人和人權捍衛者。
環境捍衛者
柬埔寨政府持續打壓環境運動。2024年，數名柬埔寨自然之母（Mother Nature Cambodia）運動人士遭判6至8年徒刑。5月，揭露非法伐木情況的環境記者吳茂（Ouk Mao）於上丁省（Stung Treng）遭到逮捕。其他調查記錄森林砍伐與環境破壞的捍衛者正陸續遭當局指控散播虛假訊息或煽動製造「社會動亂」。
環境運動人士烏倫（Ouch Leng）於2024年11月在上丁省調查保護林區非法伐木時被柬埔寨軍方逮捕，此後持續受到騷擾。獲釋後，警方包圍烏倫的住所，迫使他逃往國外。
原住民權利
柬埔寨現行法律繁瑣複雜，原住民社群取得身份認證已是不易，還須面對障礙重重的產權申請程序，以致許多社群無法成功登記集體土地產權。土地權屬缺乏保障，使得社群在面臨農業企業、碳抵換計劃及觀光基礎建設的威脅時，更易遭到強制遷離。
原住民社群深受掠奪式微型金融放貸之苦。微型金融機構接受由地方政府簽發、但與社群集體土地產權重疊的「簡易產權證書」作為擔保，這種做法削弱了原住民土地的法律保護。過度負債導致強迫出售土地、糧食取得受限以及喪失傳統生計和工作機會。人權觀察和其他組織均曾報導與負債相關的原住民借款人自殺事件。
因應柬埔寨公民社會組織提出的投訴，國際金融公司的內部監督機制已完成相關調查，但截至發稿時，結果尚未公佈。2023年的初步審查發現借債人「蒙受損害的跡象」，以及國際金融公司績效標準（包括原住民社區條款）遭到違反的情形，因此啟動全面調查。
邊境衝突與返國移駐勞工
泰國和柬埔寨的邊境衝突於7月爆發，造成包括兒童在內的平民傷亡，約30萬人流離失所，多處宗教和文化遺址毀壞。人權觀察指出，爭戰時兩國均在人口密集地區使用爆炸性武器。
衝突爆發前，爭議邊界上埋設的地雷將泰國兵士嚴重炸傷。泰國與柬埔寨皆批准1997年禁止地雷條約，該約全面禁止生產、轉讓、儲存和使用殺傷人員地雷。柬埔寨指控泰國使用國際公約禁用的集束彈藥。10月25日，居住於柏威夏省靠近泰國邊境地區的10歲男童森索萬（Sern Sovann），據報從住家附近農地帶回一件不明物品後不久即因爆炸身亡。柬埔寨指控該物是集束彈藥的未爆殘餘，但泰國否認此說法。
兩國停火協議於7月28日生效，但局勢依然緊張。截至11月，仍有18名柬埔寨士兵被泰國羈押。
衝突爆發後，逾90萬名柬埔寨移駐勞工因擔憂受到騷擾自泰國返鄉。柬埔寨政府也呼籲移工回國，並承諾提供就業機會，然而返國工人的基本生活條件急需援助且缺乏穩定生計。微型金融貸款的信貸人員上門催收欠款，讓債務沉重的家庭壓力倍增。
網絡詐騙中心
網絡詐騙園區將受害者販運至柬埔寨並強迫他們從事犯罪活動，關於此類運作手法的報導不斷增加。儘管當局偶有突擊行動，但各方通報顯示，網絡詐騙園區的人權侵害一直存在結構性因素：遭囚禁者得不到保護，也難以獲得支援與協助。
1月21日，柬埔寨當局拘留了兩名記者，原因是他們分屬的兩家媒體發佈了一段據稱拍攝到金邊網絡詐騙園區使用酷刑的影片。警方將兩人以煽動罪起訴，指控他們散播危及國家安全、有損國家領導人尊嚴的虛假資訊。